怎样在NCBI上查找基因缩写名如拟南芥的为At,在知道基因序号和CDS序列前提
去ensemble直接选择拟南芥,然后搜索基因序列号就能出来对应的常用基因名。或者ncbi可以blast cds序列,找到对应的基因组位置,然后去ucsc genome browser,选择物种,输入基因组位置,就能看到对应的基因了,名字标在transcript前面
如何在NCBI查找一个已知植物基因的启动子序列,求详细步骤,非常感谢!
首先选择Gene的标签,输入基因名,然后点击搜索,然后出来一大堆基因,选择你的那个物种的基因,点击,进去看一下,选择Mapviewer然后找到序列,选择基因的外显子上游2000bp,下载。。。
怎样获取一个植物的未知DNA序列?
将植物的部分组织进行匀浆,抽提DNA。跑一下琼脂糖凝胶电泳。检验一下是否提到DNA。然后用PCR进行扩增,这里你要查询一下你所需要的引物。在一些文献里会有你所需要的引物,如果没有就需要自己设计引物。扩增完再跑一下胶,看扩增的情况。然后跑DGGE,然后割胶,进行纯化。纯化完成后进行克隆。很后就可以送到生物公司进行测序了!你所说的ANTIPOTER,暂时还不是很清楚。
有兴趣可以讨论一下。
怎么寻找基因名称
1 打开NCBI主页
2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称
3 在出来的所有条目*一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。
4 再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的蓝色数字,往往开头有AK、NM的开头,点击它,再出现的下拉框里选择GENEBANK。
5 很下面就是他的基因序列 当然也可以参考页面上提供的CDS区域范围来看。
怎么寻找基因名称?
如果有基因序列,请用BLAST.网址搜索一下就有了.以下介绍来自维基百科:
生物资讯学中,BLAST(Basic Local Alignment Search Tool") 它是一个用来比对生物序列的一级结构(如不同蛋白质的氨基酸序列或不同基因的DNA序列)的算法. 已知一个包含若干序列的数据库,BLAST可以让研究者在其中寻找与其感兴趣的序列相同或类似的序列. 例如如果某种非人动物的一个以前未知的基因被发现,研究者一般会在人类基因组中做一个BLAST搜索来确认人类是否包含类似的基因(通过序列的相似性)
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